Nasceu em 10 de maio de 1962, na cidade de Maków Podhalanski, Arquidiocese de Cracóvia, na Polônia. Lá, estudou até se formar em engenharia civil, história da Igreja, filosofia e teologia.

Em junho de 1992, foi ordenado presbítero, e em 1994 veio em missão para o Brasil.

Padre João Kot, Oblato de Maria Imaculada (OMI), exerceu o ministério sacerdotal entre os anos de 1995 e 2006 na Arquidiocese de Olinda e Recife.

De 2007 a 2014, foi pároco em Campo Alegre do Fidalgo e, depois, em Capitão Gervásio Oliveira na Diocese de São Raimundo Nonato (PI). Trabalhou como formador na casa de filosofia dos Oblatos em Sumaré, Arquidiocese de Campinas - SP.

Foi duas vezes conselheiro da delegação OMI do Recife – PE e duas vezes conselheiro da província oblata do Brasil.

No dia 23 de julho de 2014, pe. João foi nomeado pelo Papa Francisco bispo da Diocese de Zé Doca – MA. Sua sagração episcopal foi realizada no dia 18 de outubro de 2014, na cidade de Vitória de Santo Antão, Arquidiocese de Olinda e Recife – PE, e a posse no dia 08 de novembro de 2014, na praça da catedral, em Zé Doca – MA.