Dom José Ionilton Lisboa de Oliveira nasceu em 9 de março de 1962, em Araci (BA). Formou-se em Filosofia no Instituto Nossa Senhora das Vitórias e em Teologia na Escola Teológica do Mosteiro São Bento, concluindo seus estudos em 1991, com convalidação do curso de Teologia pela Universidade Católica de Salvador (UCSAL) em 2015. Ingressou na Sociedade das Divinas Vocações (SDV), onde professou os votos religiosos em 21 de janeiro de 1990.

Foi ordenado presbítero em 19 de janeiro de 1992, na Paróquia Nossa Senhora da Conceição do Raso, em Araci. Ao longo de seu ministério sacerdotal, exerceu diversas funções pastorais, atuando como vigário e pároco em comunidades do Rio de Janeiro e da Bahia, além de integrar o Conselho Presbiteral da Arquidiocese de Vitória da Conquista e a diretoria da Conferência dos Religiosos do Brasil (CRB), regional Bahia/Sergipe.

Em 19 de abril de 2017, foi nomeado pelo Papa Francisco como bispo prelado da Prelazia de Itacoatiara (AM). Recebeu a ordenação episcopal em 16 de julho do mesmo ano e tomou posse em 30 de julho de 2017. No âmbito nacional, destacou-se por sua atuação social e pastoral, sendo eleito vice-presidente da Comissão Pastoral da Terra (CPT) em 2018, cargo no qual foi reeleito em 2021, assumindo interinamente a presidência após o falecimento de Dom André de Witte.

Comprometido com a defesa do meio ambiente e dos povos amazônicos, Dom José Ionilton também integra a Rede Eclesial Pan-Amazônica (REPAM Brasil) como secretário. Em 3 de novembro de 2023, foi nomeado prelado do Marajó, e sua posse como 5º bispo da Prelazia do Marajó ocorreu em 25 de julho de 2024, com a presença do Núncio Apostólico no Brasil, iniciando oficialmente seu pastoreio nessa nova missão episcopal.