Protógenes José Luft, SdC, nasceu em 6 de maio de 1949, em Palmeira das Missões (RS). Realizou sua formação básica e seminarística no Rio Grande do Sul, cursando o ensino médio em Canela, Filosofia no Educandário São Luiz, em Porto Alegre, e Teologia no Seminário Monsenhor Aurélio Bacciarini, em Roma, além do Ano de Pastoral na PUC de Porto Alegre. Foi ordenado presbítero em 7 de dezembro de 1975, na cidade de Chapada (RS).

Antes do episcopado, exerceu diversas atividades ligadas à educação, formação religiosa e pastoral, sobretudo no âmbito da Congregação dos Servos da Caridade. Atuou como educador em patronatos, formador de seminaristas, superior de comunidades religiosas em diferentes cidades do sul do Brasil, além de diretor de escolas mantidas pela congregação. Também exerceu o ministério paroquial, destacando-se como pároco da Paróquia Santa Cruz, em São Paulo.

Entre 1995 e 2000, foi superior provincial da Província Santa Cruz dos Servos da Caridade, período em que consolidou sua experiência de governo e animação pastoral. Em razão de problemas de saúde do então bispo diocesano de Barra do Garças, Dom Antônio Sarto, foi escolhido pela Santa Sé como bispo coadjutor da diocese, sendo nomeado em 26 de janeiro de 2000.

Protógenes José Luft recebeu a ordenação episcopal em 26 de março de 2000, em Porto Alegre, e tomou posse como bispo coadjutor de Barra do Garças no mesmo ano. Tornou-se bispo diocesano em 23 de maio de 2001, tornando-se o segundo bispo da Diocese de Barra do Garças (MT). Seu ministério episcopal é orientado pelo lema “Propter caritatem” (“Por causa da caridade”), expressão que sintetiza sua espiritualidade e serviço pastoral.